探针设计网站-探针设计的基本原理
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简述信息一览：
苏州大学医学院网站网址
苏州大学医学院导师名有：朱广友、谢可鸣、王雪峰、夏春林、韩宏岩、沈敏、冯一中、施勤、徐建荣、王明华、卓先义、吴淑燕、周翊峰、朱建周迎会、陈忆赵英伟等。网站查询：基础医学与生物科学学院：http：//jysw.suda.edu.cn/2632/list.htm。
苏州大学教务处登录入口 苏州大学 教务处登录入口为 http：//jwb.suda.edu.cn ，学生可以***该网址到浏览器地址进入登录页面。
经教育部和江苏省人民***批准，苏州蚕桑专科学校、苏州丝绸工学院、苏州医学院先后于1995年、19***年、2000年并入苏州大学。
苏州大学医学部在独墅湖校区。医学部现有基础医学与生物科学学院、放射医学与防护学院、公共卫生学院、药学院、护理学院等5个学院、3个临床医学院和9个研究院所。现有在校研究生3000余名、全日制本科生近5000名、外国留学生500余名。医学部现有教职工800余人，三家直属附属医院具有教学职称的教师1046人。
年全国院系调整，由东吴大学之文理学院、苏南文化教育学院、江南大学之数理系合并组建苏南师范学院，同年更名为江苏师范学院。1982年，学校更复名苏州大学（Soochow University）。其后，苏州蚕桑专科学校（1995年）、苏州丝绸工学院（19***年）和苏州医学院（2000年）等相继并入苏州大学。
探针设计与引物设计的区别是什么呢?
1、基因探针是一段带有检测标记、与目的基因互补的核酸序列，可以是DNA或RNA。 基因探针通过分子杂交与目的基因结合，产生杂交信号，从而在基因组中识别目的基因。 作为探针的核酸序列至少需要满足两个条件：一是为单链，二是带有可检测的标记。
2、如果你做的事荧光定量PCR，其引物和一般引物在构成上是没有什么区别的，只是要更加注意引物二聚体、PCR产物大小等问题。染料法不需要其他东西，探针法还需要taqman探针，这个探针的设计是比较有讲究的，并且上面有荧光集团和猝灭基团。具体设计，一般使用相关软件进行。
3、只要是符合要求的DNA片段都可以用来做探针和引物，探针和引物是两个完全不同的概念，他们都是DNA或者RNA，只是用的方法不一样。说的简单些：引物是用来扩增DNA序列，探针用来与特定的DNA片段做分子杂交的 第二个问题：微卫星引物是微卫星两端的侧翼序列，是用来扩增微卫星片段的。
定量PCR的优化
1、第六步：一般的定量PCR反应体系与普通PCR其实也差不了多少，只是要加入Taqman探针，另外不同就是分步法的不同。其中需要注意的是： 扩增酶最好选用热启动酶 引物和探针的浓度需要进行优化，有人建议从50nM开始，在50nM—900nM之间优化，一般为200nM（注意探针需要避光保存。
2、为了获取有意义的数据，这种情况下必须对qRT-PCR进行优化。没有正确地设置基线和阈值线 为了得到精确的Ct值，应当在丰度最高的样品所对应Ct值两个循环之前设置基线。为了使实时荧光定量PCR的数据有意义，应当在指数扩增期设置阈值线。典型情况下，阈值应当设置在基线至少10个标准差范围内。
3、出现多条条带表示PCR反应的特异性不高，可以进行如下优化尝试：适当提高PCR的退火温度。退火温度越高，DNA分子之间的配对越困难。这样可以减少引物与模板之间非特异性的结合。检查一下引物的Tm值和序列结构，如果引物Tm值过高，上下游引物Tm值相差太大，或者引物单链易形成高级结构，都不利于PCR反应。
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